Медицинский факультет:

• Кафедра пропедевтики внутренних болезней;

• Кафедра биологии и биохимии;

• Кафедра микробиологии вирусологии и иммунологии;

• Кафедра неврологии, психиатрии и психологии; 

• Кафедра «Истории Казахстана и социально-общественных дисциплин»;

• Кафедра нормальной и патологической физиологии;

• Кафедра физической культуры;

• Кафедра нормальной анатомии;

• Кафедра патологической анатомии и гистологии;

• Кафедра гигиены и эпидемиологии;

• Кафедра социального медицинского страхования и общественного здоровья;

• Кафедра скорой медицинской помощи и сестринского дела;

• Кафедра стоматологических дисциплин; 

• Кафедра Педиатрия-2. 

Фармацевтический факультет:

• Кафедра химических дисциплин;

• Кафедра фармакогнозии;

• Кафедра казахского, русского и латинского языков;

• Кафедра иностранных языков;

• Кафедра социально-гуманитарных дисциплин;

• Кафедра медбиофизики и информационных технологий;

• Кафедра фармакологии, фармакотерапии и клинической фармакологии;

• Кафедра фармацевтической и токсикологической химии;

• Кафедрой организации и управления фарм.делом;

• Кафедра технологии лекарств;

• Кафедра технологии фармацевтического производства;

Интернатура: 

• Кафедра хирургических дисциплин;

• Кафедра Хирургия-2;

• Кафедра терапевтических дисциплин;

• Кафедра педиатрии и детской хирургии;

• Кафедра инфекционных болезней и дерматовенерологии;

• Кафедра врач общей практики – 1;

• Кафедра врач общей практики – 2;

• Кафедра акушерства и гинекологии. 

Кафедры медицинскогого колледжа

• Кафедра клинических дисциплин

• Кафедра сестринского дела

• Кафедра общего образования

 Отдел Резидентуры

• Кафедра семейной медицины