- Трудовой кодекс Республики Казахстан, № 251-III от 15.05.2007;

- Закон РК «Об образовании», № 319-III, от 27.06.2007 г.;

- Закон РК от 21 июля 2007 года № 303 «О государственных закупках»;

- Закон РК «О науке» от 9 июля 2001 года № 225;

- Закон РК «О борьбе с коррупцией» от 2 июля 1998 г. N 267 (с изменениями и дополнениями по состоянию на 16.01.2013 г.);

- Закон Республики Казахстан от 11 июля 1997 года № 151-I «О языках в Республике Казахстан» (с изменениями и дополнениями по состоянию на 03.07.2013 г.);

- постановление Правительства Республики Казахстан № 499 от 20.05.2013 г. «Об утверждении Типовых правил деятельности организаций образования соответствующих типов, в том числе Типовых правил организаций образования реализующих дополнительные образовательные программы для детей»;

- постановление Правительства Республики Казахстан № 235 от 17 февраля 2012 года «Правила присвоения звания «Лучший преподаватель вуза» и направлений расходования присвоенного государственного гранта»;

- постановление Правительства РК от 27 декабря 2007 года № 1301 «Об утверждении Правил осуществления государственных закупок»;

- Государственная программа развития образования Республики Казахстан на 2011-2020 годы, утвержденная Указом Президента Республики Казахстан от 07.12.2010 г. № 1118;

- Государственная программа развития здравоохранения Республики Казахстан «Саламатты Қазақстан» на 2011-2015 годы, утвержденная Указом Президента Республики Казахстан от 29 ноября 2010 г. № 1113;

- План мероприятий по реализации Государственной программы развития здравоохранения Республики Казахстан «Саламатты Қазақстан» на 2011-2015 годы, утвержденный постановлением Правительства Республики Казахстан от 29 января 2011 г. № 41;

- Постановлением Правительства Республики Казахстан № 452 от 2 июня 2007 г. «Квалификационные требования, предъявляемые прилицензирования образовательной деятельности», с внесенными изменениями в Постановлении Правительства РК № 778 от 11 июня 2012 г.;

- приказ МОН РК № 152 от 20 апреля 2011 года «Правила организации учебного процесса по кредитной технологии обучения»;

- приказ и.о. Министра здравоохранения Республики Казахстан от 12 августа 2011 г. № 534 «Концепция развития медицинского и фармацевтического образования Республики Казахстан на 2011-2015 годы»;

- приказ МОН РК № 16 от 22 января 2010 года «Об утверждении Правил аттестации педагогических работников»;

- приказ Министра здравоохранения РК от 16 июня 2010 г. № 452 «Об утверждения Положения об интернатуре»;

- приказ МОН РК № 506 от 01 ноября 2010 года «О внесении изменений в приказ № 125 от 18.03.2008 г. «Об утверждении Типовых правил проведения контроля успеваемости, промежуточной и итоговой аттестации учащихся»

- приказ МОН РК № 338 от 13.07.2009 г. «Типовые Квалификационные характеристики должностей педагогических работников и приравненных к ним лиц»;

- приказ и.о. Министра культуры и информации Республики Казахстан № 128 от 25 сентября 2009 года «Типовые правила документирования и управления документацией в государственных и негосударственных организациях»;

- приказ МЗ РК № 887 от 31 декабря 2009 года «Қазақстан Республикасы Денсаулық сақтау министрлігінде іс жүргізуді мемлекеттік тілге көшіру туралы»;

-приказ МЗ РК № 28 от 30 января 2008 года «Об утверждении Положения о резидентуре»;

- приказ Министра здравоохранения РК от 30 января 2008 года № 27 «Об утверждении перечней клинических специальностей подготовки в интернатуре и резидентуре»;

- приказ МОН РК № 125 от 18.03.2008 г. «Об утверждении Типовых правил проведения контроля успеваемости, промежуточной и итоговой аттестации учащихся»;

- приказ МОН РК № 638 от 9 декабря 2008 года «Правила перевода и восстановления обучающихся по типам организации образования»;

- приказ Министра Здравоохранения РК от 11 мая 2007 г. № 302 «Положение о клинических базах высших медицинских организаций образования»;

- приказ МОН РК № 583 от 29.11.2007 г. «Правила организации и осуществления учебно-методической работы»;

- приказ МОН РК № 635 от 14.12.2007 г. «Правила конкурсного замещения должностей профессорско-преподавательского состава, научных работников высших учебных заведений»;

- приказ МОН РК № 644 от 21.12.2007 года «Типовые правила деятельности методического (учебно-методического, научно-методического) совета и порядок его избрания»;

- приказ Министра здравоохранения РК от 28 декабря 2007 г. № 765 «Квалификационные характеристики медицинских и фармацевтических специальностей»;

- приказ мон РК № 624 от 17.09.2003 г. «Программа и методические рекомендации по организации проведения государственной аттестации и проверки организаций, реализующих образовательные программы высшего профессионального и послевузовского профессионального образования на соблюдение требований, содержащихся в лицензии»;

- Государственный общеобязательный стандарт высшего образования. Утвержден постановлением Правительства Республики Казахстан от 22 августа 2012 года № 1080;

- Государственные общеобязательные стандарты образования РК по медицинским и фармацевтическим специальностям бакалавриата, ГОСО- 2006, ГОСО-2009;

- Государственный общеобязательный стандарт образования Республики Казахстан. Высшее образование. Бакалавриат. Основные положения», ГОСО РК 5.04.019-2011, утвержденный приказом МОН РК № 261 от 17.06.2011 г.;      

- ГОСО РК 5.03.006-2006 «Система образования Республики Казахстан.   Контроль и оценка знаний в высших учебных заведениях. Основные положения», утвержденный 25 августа 2006 года, приказ № 461;

- Государственный общеобязательный стандарт образования Республики Казахстан. «Послевузовское образование. Магистратура. Основные положения», ГОСО РК 5.04.033-2011, утвержденный приказом МОН РК № 261 от 17 июня 2011 г.;    

- Государственные общеобязательные стандарты образования Республики Казахстан. Послевузовское образование. «Магистратура» (по специальностям), ГОСО РК - 2009, утвержденные приказом МЗ РК № 387 от 29 июля 2009 г.;     

- Государственные стандарты образования Республики Казахстан. «Резидентура» (по специальностям), ГСО РК - 2009, утвержденные приказом МЗ РК № 387 от 29 июля 2009 г.;     

- Государственные стандарты дополнительного образования Республики Казахстан по медицинским и фармацевтическим специальностям, утвержденные приказом МЗ РК № 778 от 26.11.2009 г.;

- Государственные общеобязательные стандарты образования РК по медицинским и фармацевтическим специальностям (среднее профессиональное образование), 2010 г;

- Инструктивное письмо № 1 по составлению годовых отчетов и планов работы кафедр (курсов) медицинских вузов РК, утвержденное председателем УМО медвузов РК от 18.01.2003 г.;

- Инструктивное письмо № 2 «Об организации учебной и методической работы на кафедрах высших медицинских учебных заведений Республики Казахстан», утвержденное МЗ РК 3 марта 2004 г;

- Инструктивное письмо № 6 «По разработке учебно-методической документации на кафедрах медицинских и фармацевтических вузов и медицинских факультетов университетов РК к ГОСО – 2006», утвержденное МЗ РК от 22.06.2007 г.;

- Инструктивное письмо МОН РК № И-01 «Об организации учебного процесса в высших учебных заведениях Республики по кредитной технологии обучения», утвержденное 14 марта 2008 г.;

- Инструктивное письмо № 7 «По разработке учебно-методической документации в организациях медицинских образования и науки РК, осуществляющих подготовку магистрантов и докторантов», утвержденное МЗ РК от 27 апреля 2010 г.;

- Инструктивное письмо № 8 «По разработке учебно-методической документации в обучающих организациях Республики Казахстан, осуществляющих подготовку по резидентуре», утвержденное МЗ РК от 27 апреля 2010 года;

- Инструктивное письмо № 9 «По разработке учебно-методической документации на факультетах (курсах, отделениях) образовательных организаций, осуществляющих дополнительное медицинское и фармацевтическое образование», утвержденное МЗ РК от 27 апреля 2010 г.;

- Руководство по проведению институциональной самооценки медицинских организаций образования – национальный аккредитационный центр мон РК (Астана, 2009);

- Международный стандарт ИСО 9001-2008 Системы менеджмента качества. Требования;

Международный стандарт ИСО 9004-2009 «Менеджмент для устойчивого успеха организации. Подход менеджмента качества»

-СТ РК ИСО 9000-2009 Системы менеджмента качества. Основные положения и словарь;

- СТ РК ИСО 9001-2009 Системы менеджмента качества. Требования;

- СТ РК ИСО 9004-2009 Рекомендации по улучшению деятельности;

- СТ РК ИСО 19011-2002 Рекомендации по аудиту систем менеджмента качества и/или охраны окружающей среды;

-СТ РК 1158-2002 Образование высшее профессиональное. Материально-техническая база организаций образования;

- Положения и Правила о внутривузовской работе, охватывающие все сферы деятельности высшей школы, утвержденные на Ученом Совете академии;

- Внутренние стандарты и документированные процедуры по требованиям СТ РК ИСО 9001-2009, Международного стандарта ИСО 9001-2008;

- Устав РГП на ПХВ «Южно-Казахстанская государственная фармацевтическая академия»;

- Правила внутреннего трудового распорядка академии;

- Политика и Цели в области качества ЮКГФА;

- Ежегодное Послание Лидера нации – Президента Республики Казахстан Н.А. Назарбаева народу Казахстана;